瑶族崇奉各种自然神、图腾神和祖先神。
自然神：同其他民族一样，瑶族认为自然界中的万物都有神灵，因此他们祈求万物神灵，能驱除自然灾害，给予他们平安富足的日子。
图腾神：瑶族对氏族图腾极为崇拜，认为它具有莫大的神力。盘瓠，亦称盘王、盘护、盘古等，是神话传说中龙犬的名字。瑶族的盘瓠崇拜，实际上是一种图腾崇拜。很多瑶族人都认为盘瓠是瑶族的始祖，把他当作始祖神加以崇拜、祭祀与供奉，瑶族的先民每逢迁徙，必携带祖先偶像，每到一处，必先立盘王庙，以进行祭祀。祭祀分为大祭和小祭。大祭每隔三四年或数十年进行一次，规模宏大，以宗族或连村的方式进行，祭期为三至五天，要进行隆重的祭祀仪式。唱盘王歌，击黄泥鼓，以歌颂祖宗的丰功伟绩，欢庆是年的五谷丰收。除集体仪式外，各家各户还要杀鸡宰猪，宾朋好友会聚一堂。小祭是以户为单位进行的，每年或每两年进行一次，主要的活动是本户的男女老少一起拜祭盘王供像，祈求全家人平安，来年粮食丰收。
祖先神：由于瑶族人相信人死亡后有鬼魂存在，为了表示对死者的怀念和对先辈的尊敬，在死者的墓中放置工具、用具和食物，同时祈求得到祖先神的庇护。瑶族在氏族部落中还要祭拜共同的祖先：盘瓠、伏羲兄妹神、社王神、神农神等。随着社会的确立，一家一户的祖先崇拜日益盛行，把祖先的神龛放于正堂中，在神龛的上面是祖先的画像或神名，后人跪拜祖先，祈祷人丁兴旺、五谷丰登。
宋、元以来，道教和佛教相继传入瑶区。道教的传入，对瑶区影响颇大，瑶人的丧葬祭祀仪式，开始按照道教的法旨进行。同时使得。瑶区的祭祀仪式变得多样性和复杂性
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